MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC03

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015421	CAAA	2	8	500	507	75 %	0 %	0 %	25 %	330370667
2	NC_015421	TTC	2	6	548	553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370667
3	NC_015421	AGCT	2	8	612	619	25 %	25 %	25 %	25 %	330370667
4	NC_015421	TGA	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370667
5	NC_015421	AGC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
6	NC_015421	A	6	6	758	763	100 %	0 %	0 %	0 %	330370667
7	NC_015421	ACT	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
8	NC_015421	GAC	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
9	NC_015421	TA	3	6	1077	1082	50 %	50 %	0 %	0 %	330370667
10	NC_015421	AGA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370667
11	NC_015421	CTT	2	6	1210	1215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370667
12	NC_015421	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370667
13	NC_015421	CAA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370667
14	NC_015421	GCG	2	6	1303	1308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330370667
15	NC_015421	ATC	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
16	NC_015421	GAC	2	6	1385	1390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
17	NC_015421	GAA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370667
18	NC_015421	TGA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370667
19	NC_015421	AAG	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370667
20	NC_015421	ACT	2	6	1479	1484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
21	NC_015421	A	6	6	1526	1531	100 %	0 %	0 %	0 %	330370667
22	NC_015421	TCA	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
23	NC_015421	AGC	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
24	NC_015421	A	7	7	1891	1897	100 %	0 %	0 %	0 %	330370668
25	NC_015421	TTAT	2	8	1917	1924	25 %	75 %	0 %	0 %	330370668
26	NC_015421	ATT	2	6	1956	1961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370668
27	NC_015421	TGATT	2	10	1977	1986	20 %	60 %	20 %	0 %	330370668
28	NC_015421	TAT	2	6	2025	2030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370668
29	NC_015421	CAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370669
30	NC_015421	AATT	2	8	2138	2145	50 %	50 %	0 %	0 %	330370669
31	NC_015421	TCT	2	6	2207	2212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370669
32	NC_015421	A	7	7	2358	2364	100 %	0 %	0 %	0 %	330370669
33	NC_015421	TAT	2	6	2414	2419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370669
34	NC_015421	CTG	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370669
35	NC_015421	ACG	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370669
36	NC_015421	CATGC	2	10	2601	2610	20 %	20 %	20 %	40 %	330370669
37	NC_015421	TGG	2	6	2642	2647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370669
38	NC_015421	ACC	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370669
39	NC_015421	ATCA	2	8	3292	3299	50 %	25 %	0 %	25 %	330370670
40	NC_015421	GCG	2	6	3399	3404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330370670
41	NC_015421	TGA	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370670
42	NC_015421	AAT	2	6	3518	3523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370670
43	NC_015421	GT	3	6	3532	3537	0 %	50 %	50 %	0 %	330370670
44	NC_015421	T	6	6	3537	3542	0 %	100 %	0 %	0 %	330370670
45	NC_015421	TTG	2	6	3553	3558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370670
46	NC_015421	ATC	2	6	3604	3609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370670
47	NC_015421	TTG	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370670
48	NC_015421	CCT	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330370671
49	NC_015421	AATC	2	8	3669	3676	50 %	25 %	0 %	25 %	330370671
50	NC_015421	TAAT	2	8	3839	3846	50 %	50 %	0 %	0 %	330370671
51	NC_015421	GGAA	2	8	3922	3929	50 %	0 %	50 %	0 %	330370671
52	NC_015421	GTT	2	6	4177	4182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370671
53	NC_015421	TTG	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370671
54	NC_015421	A	7	7	4366	4372	100 %	0 %	0 %	0 %	330370672
55	NC_015421	GACGAA	2	12	4391	4402	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330370672
56	NC_015421	A	6	6	4455	4460	100 %	0 %	0 %	0 %	330370672
57	NC_015421	AAG	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370672
58	NC_015421	TTAA	2	8	4529	4536	50 %	50 %	0 %	0 %	330370672
59	NC_015421	TTG	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370672
60	NC_015421	GAT	3	9	4574	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370672
61	NC_015421	A	6	6	4606	4611	100 %	0 %	0 %	0 %	330370673
62	NC_015421	TAT	2	6	4677	4682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370673
63	NC_015421	TGA	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370673
64	NC_015421	AGC	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370673
65	NC_015421	CAA	3	9	4720	4728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370673
66	NC_015421	ACC	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370673
67	NC_015421	AAAAC	2	10	4808	4817	80 %	0 %	0 %	20 %	330370673
68	NC_015421	TGG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370673
69	NC_015421	A	6	6	4944	4949	100 %	0 %	0 %	0 %	330370673
70	NC_015421	AGA	2	6	4958	4963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370673
71	NC_015421	T	6	6	5124	5129	0 %	100 %	0 %	0 %	330370674
72	NC_015421	TTTTTC	2	12	5142	5153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330370674
73	NC_015421	TGG	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370674
74	NC_015421	ATTAG	2	10	5257	5266	40 %	40 %	20 %	0 %	330370674
75	NC_015421	ATCA	2	8	5286	5293	50 %	25 %	0 %	25 %	330370674
76	NC_015421	CTG	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370674
77	NC_015421	TCT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370674
78	NC_015421	GGAA	2	8	5403	5410	50 %	0 %	50 %	0 %	330370674
79	NC_015421	T	7	7	5477	5483	0 %	100 %	0 %	0 %	330370674
80	NC_015421	GTC	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370675
81	NC_015421	GCA	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370675
82	NC_015421	TGGC	2	8	5913	5920	0 %	25 %	50 %	25 %	330370675
83	NC_015421	AAC	2	6	6014	6019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370675
84	NC_015421	CAA	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370675
85	NC_015421	CCAT	2	8	6309	6316	25 %	25 %	0 %	50 %	330370675
86	NC_015421	TTC	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370675
87	NC_015421	TGA	2	6	6408	6413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370675
88	NC_015421	AGC	2	6	6420	6425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370675
89	NC_015421	TAAT	2	8	6434	6441	50 %	50 %	0 %	0 %	330370675
90	NC_015421	CAT	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370675
91	NC_015421	TGG	2	6	7589	7594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370676
92	NC_015421	ACC	2	6	7773	7778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370676
93	NC_015421	GCATG	2	10	7811	7820	20 %	20 %	40 %	20 %	330370676
94	NC_015421	TCGC	2	8	7862	7869	0 %	25 %	25 %	50 %	330370676
95	NC_015421	CGT	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370676
96	NC_015421	CAG	2	6	7964	7969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370676
97	NC_015421	ATA	2	6	8002	8007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370676
98	NC_015421	T	7	7	8057	8063	0 %	100 %	0 %	0 %	330370676
99	NC_015421	AGA	2	6	8209	8214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370676
100	NC_015421	AATT	2	8	8276	8283	50 %	50 %	0 %	0 %	330370676
101	NC_015421	TTG	2	6	8288	8293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370676
102	NC_015421	CTT	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370677
103	NC_015421	T	6	6	8562	8567	0 %	100 %	0 %	0 %	330370677
104	NC_015421	AAT	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370677
105	NC_015421	T	6	6	8627	8632	0 %	100 %	0 %	0 %	330370677
106	NC_015421	TGG	2	6	8647	8652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370677
107	NC_015421	TAAAGT	2	12	8669	8680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	330370677
108	NC_015421	CA	3	6	8699	8704	50 %	0 %	0 %	50 %	330370677
109	NC_015421	CAC	2	6	8708	8713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370677
110	NC_015421	ACC	2	6	8755	8760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370677
111	NC_015421	TTA	2	6	9335	9340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370678
112	NC_015421	A	6	6	9439	9444	100 %	0 %	0 %	0 %	330370678
113	NC_015421	GGA	2	6	9496	9501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330370678
114	NC_015421	CCA	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370678
115	NC_015421	AT	3	6	9538	9543	50 %	50 %	0 %	0 %	330370678
116	NC_015421	ATC	2	6	9591	9596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370678
117	NC_015421	TTAAT	2	10	9649	9658	40 %	60 %	0 %	0 %	330370678
118	NC_015421	TGG	2	6	9762	9767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370679
119	NC_015421	CATT	2	8	9780	9787	25 %	50 %	0 %	25 %	330370679
120	NC_015421	ATT	2	6	9894	9899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370679
121	NC_015421	ATC	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370679
122	NC_015421	TAC	2	6	10059	10064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370680
123	NC_015421	CCA	2	6	10073	10078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370680
124	NC_015421	TAT	2	6	10081	10086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370680
125	NC_015421	T	8	8	10106	10113	0 %	100 %	0 %	0 %	330370680
126	NC_015421	TAT	3	9	10117	10125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370680
127	NC_015421	ATT	2	6	10187	10192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370680
128	NC_015421	AGA	2	6	10241	10246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370680
129	NC_015421	CAAG	2	8	10249	10256	50 %	0 %	25 %	25 %	330370680
130	NC_015421	TTG	2	6	10322	10327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370680
131	NC_015421	TGT	2	6	10341	10346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370680
132	NC_015421	TTG	2	6	10358	10363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370680
133	NC_015421	GTT	2	6	10378	10383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370680
134	NC_015421	AGCA	2	8	10472	10479	50 %	0 %	25 %	25 %	330370680
135	NC_015421	GT	3	6	10527	10532	0 %	50 %	50 %	0 %	330370680
136	NC_015421	TTC	2	6	10595	10600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.